在上海申请落户过程中，若持有的《上海市居住证》已过期，可能会影响落户资格的认定和相关积分、居转户等政策的适用。根据上海市现行规定，居住证是办理居住登记、积分申请、子女教育、医保社保及人才引进类落户的重要凭证，必须保持有效状态。

首先，居住证过期后应及时续签。持证人应在居住证到期前30日内，通过“一网通办”平台或社区事务受理服务中心提交续签申请，提供身份证、房产证或租赁合同、社保缴纳记录等材料。续签审核通过后，居住证有效期将延续，一般为1至3年，具体视个人情况而定。

若居住证过期未及时续签，可能导致以下问题：一是中断居住证累计持有年限，影响“居转户”（如7年居住证+社保+个税+中级职称等条件）的连续性认定；二是在申请积分入户或人才引进时，系统无法验证有效居住状态，导致申请被驳回；三是影响随迁家属的相关权益，如子女入学、医保参保等。

对于正在办理落户但居住证过期的情况，建议立即补办续签，并向人力资源社会保障局或公安户籍部门说明情况，提供补办证明。部分情形下，若过期时间较短（如30天内），且能提供合理解释和连续居住、社保缴纳等佐证材料，相关部门可能酌情处理，不影响落户流程。

特别提醒：居住证有效期与居住登记状态密切相关。即使证件未到期，若实际居住地址变更而未更新登记，也可能被视为无效。因此，务必确保居住信息及时更新，保持社保、个税正常缴纳，维持居住证的有效性和连续性。

总之，在上海落户过程中，居住证必须保持有效。一旦过期，应尽快补办续签，并主动与相关部门沟通，避免因证件问题延误落户进程。